删得这么干净。难道你是一条一条删的？
在BC保存设置的文件夹内，应该有两个文件：
BCFileFormats.xml
BCFileFormats.xml.bak
用这个bak文件替换这个xml文件，可以挽回最后一次操作。
如果这样做完也已无可挽回，你只有恢复默认的文件格式了：
退出BC，删除 BCFileFormats.xml ，重新运行BC即可。
BC保存设置的文件夹，一般在：
%AppData%\Scooter Software\Beyond Compare 3
如果你用的是便携模式，那么所有设置文件都在BC的本夹内。
若仍有疑问，请“补充说明”或“追问”，我继续帮你。
