A、根据题意可知，该DNA分子长度为1000碱基对，而单独用Kpnl酶切割DNA分子后，其长度并不改变，由此说明DNA分子为环状，A错误；B、由A项可知，该DNA分子为环状，B正确；C、由于DNA分子为环状，而用EcoRI酶切后得到的DNA分子是200bp和800bp两种长度的DNA片段，说明该DNA分子上有2个EcoRI酶切位点，C错误；D、单独用EcoRI酶切割和同时EcoRI、Kpnl两种酶切割的结果不同，说明该DNA分子上有Kpnl酶切位点，D错误．故选：B．
